Мадока Канамэ (яп. 鹿目 まどか Канамэ Мадока?) — 14-летняя девочка, считающая, что у неё нет никаких талантов и всегда выступающая против насилия. В изначальном ходе истории она заключила контракт с Кюбэем и сражалась вместе с остальными героинями. Однако, в итоге погибла в бою с Вальпургиевой ночью. Совершенные Хомурой путешествия во времени создали множество миров, центральной фигурой которых стала Мадока. Благодаря этому в итоге Мадока обрела огромный магический потенциал, чрезвычайно заинтересовавший Кюбэя. В варианте истории, на котором фокусируется сериал, Хомуре удаётся удерживать Мадоку от заключения контракта до самого появления Вальпургиевой ночи. Однако, в итоге, она загадывает лично уничтожить всех ведьм — как в будущем, так и в прошлом — и исчезает из Вселенной, став божеством, забирающим себе всю скорбь волшебниц, до того, как они переродятся в ведьм.